Projekt aplikovaného výzkumu a inovací má definován cíl(e) projektu v souladu se specifickými cíli programu THÉTA 2 a způsob jejich naplnění. K naplnění stanovených cílů projektu se požaduje uplatnění konkrétních výsledků PV/EV specifikovaných zadávací dokumentaci. Uchazečem o podporu mohou být výzkumné organizace nebo podniky. Doba trvání projektu v podprogramu 1 a 2 max. 48 měsíců a max. 68 měsíců v podprogramu 3. Podporu lze poskytnout na poskytovatelem uznané způsobilé náklady projektu v souladu se zadávací dokumentací. Uchazeč je povinen prokázat svoji způsobilost k řešení navrhovaného projektu podle § 18 zákona č. 130/2002 Sb. a v souladu s podmínkami programu THÉTA 2, doručit návrh projektu v soutěžní lhůtě a způsobem uvedeným v zadávací dokumentaci.Hodnoticí kritéria jsou uvedena v zadávací dokumentaci.