Podmínky veřejné soutěže jsou uvedeny v Zadávací dokumentaci (zejm. Kap. 2). Kritéria hodnocení návrhu projektu udává program INTER-EXCELLENCE II (Kap. 14.2) a jsou dále upřesněna v Zadávací dokumentaci (Kap. 8); přičemž základní okruhy hodnocení tvoří především: vědecko-výzkumná kvalita návrhu projektu, inovativnost návrhu projektu, metodologie návrhu projektu, aplikační potenciál návrhu projektu, odborné schopnosti výzkumného týmu a úroveň bilaterální spolupráce.